LINEミニアプリチャンネルでリンクされたボットの設定をし、ボットリンク機能をOnにした場合開発用のLIFFにのみ適用されます。審査時に審査用、リリース時に本番用にも適用されたと記憶しています。
審査プロセスを見ると承認済みのLINEミニアプリでは審査完了し変更内容を公開するをクリックすると反映されるようです。
LINEミニアプリが承認されると、チャネルのステータスが「承認済み」に変わります。LINE Developersコンソールの[ワークフロー]タブにある[変更内容を公開する]ボタンを使って、手動でチャネルのステータスを「公開中」に変更する必要があります。
ステータスが「公開中」になると、審査をリクエストした際に行った変更が、公開中のチャネルおよびそのチャネルのLIFF(LINEミニアプリ名、チャネル設定、LIFF設定など)に反映されます。
https://developers.line.biz/ja/docs/line-mini-app/submit/submission-guide/#review-process